据悉，五当召保存着国家级文物9000余件，不可移动文物占地面积20多万平方米，壁画总面积900余平方米，除众多文物外，五当召古树也亟待加强保护。古树群占地面积1500公顷，平均树龄150年，最大达400年，是五当召资源遗产和文化的代表，也是僧众的信仰寄托。但因古树数量众多且分布较散，系统保护难度较大，多靠周边住户及游客的自觉意识维护。
五当召保护范围占地面积5平方公里，寺庙由七座大殿、三座活佛府、一座舍利灵塔、四十三栋僧房、三座庚毗庙组成。1996年，五当召被国务院确定为全国重点文物保护单位，2002年被评为国家4A级旅游景区。
值得肯定的是，条例自2009年8月实施以来，相关部门争取资金，对存在安全隐患的殿堂进行了整体落架维修，对全寺殿堂进行了粉刷和电路改造。邀请专家修复受损唐卡，对多座危旧僧房、破损白塔进行了修缮。每季度对各殿堂文物对照档案进行实物比对，实现了文物档案纸质文本和电子文本“双套制”管理。
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